畜禽粪便（猪粪、鸡粪、牛粪）、厨余、城市污水处理厂污泥、农作物秸秆、食品加工企业废弃物、造纸厂废渣、糖厂、酒厂废渣等均为有机肥原料，范围比较广。

　　从食物链的角度看，肥料是农作物的食物，肥料是食品的源头，控制肥料的质量是食品的前提和基础。原料易受重金属污染，也是摆在有机肥生产企业面前亟待解决的难题。

　　人类、畜禽粪便、垃圾等有机废弃物是一种含有多种病原微生物或混有有毒物质的肮脏、腐烂、恶臭的物质。它们是重要的污染源。由于畜禽养殖过程中添加剂的问题，畜禽粪便中有时会含有一些重金属。由于原料来源的多样性，有机肥如果不能完全分解或消毒灭菌处理好，会带来很多病虫害。

　　我国的有机肥料标准和行业标准执行了一项标准，该标准没有反映原料补充的来源指标。不同原料生产的有机肥对加工工艺和工艺水平的要求不同，不同原料所含重金属和有机污染物的健康指标不同，适用范围也不同。例如，城市污泥只能用于草坪和其他地方。一些工业废水和废渣产生的有机肥原料的使用范围有相应的限制。并非所有的有机肥料都能用于种植谷物和蔬菜。因此，有机肥标准的制定应存在一些差异。此外，丰度指数体现在有机肥标准中，可以拉开优良有机肥与普通有机肥的价差，使有机肥的等级划分更加明显，进一步提高我国有机肥的质量。

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